?

Log in

No account? Create an account
Мышь Эйнштейна's Journal -- Day [entries|friends|calendar]
_hellmaus_

[ website | Мои аниме-клипы ]
[ userinfo | livejournal userinfo ]
[ calendar | livejournal calendar ]

"Нестабильность, эволюция, морфогенез" [24 Dec 2011|01:38am]
Что-то в журнале стала сплошная политика. Надо про что-нибудь поприятнее написать. Например, про науку.

Я еще три года назад жаловался, что в молекулярной биологии нет хороших математических теорий с достойной предсказательной силой. Все настолько плохо, что биологи даже радиоприемник починить не могут. Тогда мы в обсуждении уперлись в то, что продукты эволюции, будь то генные сети или прошивки для ПЛИС, устроены принципиально не так, как творения инженеров. Причем биологи (например, я), интуитивно понимают это отличие, а сформулировать строго не могут. Злые физики упрекают их за это в "витализме".

Однако прогресс идет, и есть на свете математики, которые над этим успешно работают. Одного из них зовут Сергей Вакуленко, работает он в питерском институте проблем машиноведения РАН, и я как раз дочитал его громадный обзор (pdf). (скоро выложу русский перевод). Кстати, он неожиданно приятно пишет. Например, с него станется завершить обзор фразой "поэтому предсказать Конец Света невозможно по фундаментальным причинам".

Вкусность первая: у него есть строгое математическое определение жизнеспособности. Любой организм рано или поздно умирает. Любой самый процветающий вид может через десяток миллионов лет вымереть, не оставив потомков. Поэтому жизнеспособность определяется для последовательности размножающихся систем (клеток, особей..) через вероятность выживания: если при времени, стремящемся к бесконечности, она стремится к числу больше нуля - система жизнеспособна. Если к нулю - нет. Определение, кстати, не его, а из книги 1984 года, но современные биологи с ним в массе незнакомы.

Вкусность вторая: этого определения автору хватает, чтобы описать важные ограничения на структуру и эволюцию живого. Для начала, он доказывает, что система, размножающаяся без мутаций - не жилец. Далее, если количество регуляторных генов чем-то жестко ограничено - тоже не жилец. Поэтому сложность генных регуляторных сетей со временем растет, даже если все, что от них требуется - это противостоять случайностям внешней среды. Даже такая мелочь, как распределение количества связей генов, важна! Если новые связи равновероятно образуют все гены - сеть не жилец. У жизнеспособных генных сетей вероятность появления у гена новой связи пропорциональна количеству тех связей, которые у него уже есть. Поэтому реальные генные сети оказываются примером безмасштабных сетей

20 comments|post comment

[24 Dec 2011|05:40pm]
Вернулся с митинга, все нормально. Народу было раза в два побольше, чем на Болотной.
Внезапно выступал prahvessor Гельфанд!

Удивило, что у многих ораторов, включая Немцова с Навальным, голоса - будто они неделю из запоя не выходят. Интересно, что там с ними?
5 comments|post comment

navigation
[ viewing | December 24th, 2011 ]
[ go | previous day|next day ]